Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RASGRF2O14827 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASGRF2O14827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASGRF2O14827 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RASGRF2O14827 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASGRF2O14827 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASGRF2O14827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRF2O14827 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASGRF2O14827 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASGRF2O14827 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASGRF2O14827 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms