Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOK3O14730 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIOK3O14730 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK3O14730 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RIOK3O14730 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIOK3O14730 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIOK3O14730 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK3O14730 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms