Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM38O00635 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM38O00635 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM38O00635 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM38O00635 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM38O00635 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM38O00635 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms