Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL22O00626 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL22O00626 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL22O00626 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL22O00626 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL22O00626 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL22O00626 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL22O00626 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL22O00626 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL22O00626 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL22O00626 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL22O00626 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL22O00626 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL22O00626 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL22O00626 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL22O00626 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL22O00626 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL22O00626 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL22O00626 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL22O00626 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL22O00626 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCL22O00626 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL22O00626 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL22O00626 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL22O00626 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL22O00626 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL22O00626 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL22O00626 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL22O00626 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL22O00626 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL22O00626 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL22O00626 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL22O00626 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL22O00626 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL22O00626 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL22O00626 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL22O00626 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCL22O00626 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL22O00626 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL22O00626 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL22O00626 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL22O00626 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL22O00626 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL22O00626 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL22O00626 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL22O00626 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL22O00626 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL22O00626 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL22O00626 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL22O00626 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL22O00626 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL22O00626 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL22O00626 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL22O00626 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL22O00626 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL22O00626 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL22O00626 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL22O00626 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL22O00626 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL22O00626 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL22O00626 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL22O00626 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL22O00626 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL22O00626 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL22O00626 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL22O00626 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL22O00626 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL22O00626 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL22O00626 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL22O00626 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL22O00626 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL22O00626 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL22O00626 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL22O00626 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms