Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP2O00295 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP2O00295 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP2O00295 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TULP2O00295 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TULP2O00295 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP2O00295 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP2O00295 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TULP2O00295 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP2O00295 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TULP2O00295 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP2O00295 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TULP2O00295 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP2O00295 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TULP2O00295 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP2O00295 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TULP2O00295 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP2O00295 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP2O00295 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TULP2O00295 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TULP2O00295 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP2O00295 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP2O00295 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TULP2O00295 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TULP2O00295 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP2O00295 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TULP2O00295 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP2O00295 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP2O00295 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP2O00295 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TULP2O00295 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP2O00295 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TULP2O00295 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TULP2O00295 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP2O00295 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP2O00295 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TULP2O00295 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TULP2O00295 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP2O00295 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TULP2O00295 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP2O00295 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TULP2O00295 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP2O00295 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TULP2O00295 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP2O00295 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP2O00295 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP2O00295 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TULP2O00295 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP2O00295 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP2O00295 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP2O00295 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP2O00295 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TULP2O00295 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TULP2O00295 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP2O00295 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP2O00295 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TULP2O00295 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP2O00295 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TULP2O00295 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP2O00295 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP2O00295 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TULP2O00295 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP2O00295 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP2O00295 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TULP2O00295 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP2O00295 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP2O00295 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP2O00295 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP2O00295 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TULP2O00295 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP2O00295 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TULP2O00295 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TULP2O00295 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TULP2O00295 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP2O00295 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP2O00295 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP2O00295 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP2O00295 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TULP2O00295 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP2O00295 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP2O00295 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP2O00295 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TULP2O00295 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP2O00295 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP2O00295 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TULP2O00295 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP2O00295 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TULP2O00295 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TULP2O00295 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms