Protein–RNA interactions for Protein: H7C423

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C423 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H7C423 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H7C423 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H7C423 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H7C423 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H7C423 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H7C423 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H7C423 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H7C423 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H7C423 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H7C423 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H7C423 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
H7C423 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C423 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C423 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C423 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C423 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C423 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C423 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C423 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C423 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C423 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C423 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C423 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C423 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C423 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C423 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H7C423 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C423 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C423 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C423 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C423 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H7C423 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C423 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C423 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C423 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H7C423 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C423 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C423 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C423 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H7C423 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C423 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C423 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C423 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H7C423 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C423 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H7C423 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C423 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C423 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H7C423 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H7C423 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C423 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H7C423 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H7C423 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H7C423 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H7C423 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H7C423 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H7C423 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H7C423 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H7C423 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H7C423 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H7C423 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H7C423 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H7C423 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C423 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H7C423 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C423 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C423 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H7C423 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H7C423 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H7C423 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H7C423 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H7C423 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H7C423 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H7C423 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H7C423 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H7C423 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C423 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C423 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C423 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C423 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H7C423 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H7C423 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms