Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H7C1H1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C1H1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C1H1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C1H1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H7C1H1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H7C1H1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H7C1H1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H7C1H1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H7C1H1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H7C1H1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H7C1H1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H7C1H1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1H1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1H1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1H1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H7C1H1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1H1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1H1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1H1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1H1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H7C1H1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1H1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1H1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H7C1H1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1H1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1H1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1H1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H7C1H1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1H1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1H1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1H1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H7C1H1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H7C1H1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H7C1H1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H7C1H1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H7C1H1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H7C1H1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H7C1H1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H7C1H1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H7C1H1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C1H1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H7C1H1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C1H1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C1H1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C1H1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C1H1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H7C1H1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H7C1H1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H7C1H1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H7C1H1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H7C1H1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H7C1H1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H7C1H1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C1H1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C1H1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C1H1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H7C1H1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H7C1H1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H7C1H1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H7C1H1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C1H1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C1H1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C1H1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C1H1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H7C1H1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C1H1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C1H1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C1H1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H7C1H1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H7C1H1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C1H1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C1H1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C1H1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C1H1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H7C1H1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H7C1H1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H7C1H1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C1H1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C1H1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H7C1H1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H7C1H1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms