Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BHMG1C9JSJ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BHMG1C9JSJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BHMG1C9JSJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BHMG1C9JSJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BHMG1C9JSJ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BHMG1C9JSJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BHMG1C9JSJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms