Protein–RNA interactions for Protein: C9JG80

NPIPB4, Nuclear pore complex-interacting protein family member B4, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB4C9JG80 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPIPB4C9JG80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB4C9JG80 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPB4C9JG80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPB4C9JG80 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPB4C9JG80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms