Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf58C9J3I9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf58C9J3I9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf58C9J3I9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C5orf58C9J3I9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C5orf58C9J3I9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C5orf58C9J3I9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C5orf58C9J3I9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms