Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELOA3DA6NLF2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOA3DA6NLF2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELOA3DA6NLF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ELOA3DA6NLF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ELOA3DA6NLF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms