Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ64

Putative NPIP-like protein LOC729978, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJ64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJ64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A6NJ64 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJ64 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A6NJ64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJ64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A6NJ64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJ64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJ64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJ64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJ64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A6NJ64 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJ64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJ64 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A6NJ64 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJ64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJ64 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A6NJ64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A6NJ64 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJ64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJ64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJ64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJ64 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJ64 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJ64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJ64 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJ64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJ64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJ64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJ64 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJ64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A6NJ64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
A6NJ64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJ64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJ64 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NJ64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NJ64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NJ64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A6NJ64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NJ64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NJ64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NJ64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A6NJ64 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NJ64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NJ64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A6NJ64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NJ64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NJ64 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NJ64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NJ64 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A6NJ64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NJ64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NJ64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A6NJ64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NJ64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A6NJ64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A6NJ64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A6NJ64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NJ64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NJ64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NJ64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A6NJ64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NJ64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NJ64 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NJ64 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NJ64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A6NJ64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NJ64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A6NJ64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NJ64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A6NJ64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NJ64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NJ64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NJ64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NJ64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A6NJ64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NJ64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A6NJ64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NJ64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NJ64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A6NJ64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NJ64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NJ64 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A6NJ64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NJ64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A6NJ64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NJ64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NJ64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NJ64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A6NJ64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NJ64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NJ64 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A6NJ64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NJ64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A6NJ64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms