Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCRBV5S2A0A599 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCRBV5S2A0A599 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCRBV5S2A0A599 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV5S2A0A599 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV5S2A0A599 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV5S2A0A599 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TCRBV5S2A0A599 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCRBV5S2A0A599 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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