Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TCRBV5S2A0A599 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TCRBV5S2A0A599 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TCRBV5S2A0A599 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TCRBV5S2A0A599 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TCRBV5S2A0A599 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TCRBV5S2A0A599 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TCRBV5S2A0A599 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TCRBV5S2A0A599 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TCRBV5S2A0A599 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TCRBV5S2A0A599 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCRBV5S2A0A599 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCRBV5S2A0A599 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCRBV5S2A0A599 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TCRBV5S2A0A599 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TCRBV5S2A0A599 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCRBV5S2A0A599 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCRBV5S2A0A599 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCRBV5S2A0A599 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCRBV5S2A0A599 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCRBV5S2A0A599 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TCRBV5S2A0A599 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCRBV5S2A0A599 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCRBV5S2A0A599 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCRBV5S2A0A599 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TCRBV5S2A0A599 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCRBV5S2A0A599 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCRBV5S2A0A599 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCRBV5S2A0A599 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCRBV5S2A0A599 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCRBV5S2A0A599 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCRBV5S2A0A599 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCRBV5S2A0A599 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCRBV5S2A0A599 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCRBV5S2A0A599 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCRBV5S2A0A599 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCRBV5S2A0A599 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCRBV5S2A0A599 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCRBV5S2A0A599 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCRBV5S2A0A599 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCRBV5S2A0A599 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCRBV5S2A0A599 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCRBV5S2A0A599 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TCRBV5S2A0A599 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCRBV5S2A0A599 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCRBV5S2A0A599 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCRBV5S2A0A599 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCRBV5S2A0A599 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCRBV5S2A0A599 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCRBV5S2A0A599 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCRBV5S2A0A599 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCRBV5S2A0A599 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCRBV5S2A0A599 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S2A0A599 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCRBV5S2A0A599 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S2A0A599 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCRBV5S2A0A599 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCRBV5S2A0A599 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S2A0A599 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S2A0A599 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S2A0A599 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S2A0A599 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCRBV5S2A0A599 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCRBV5S2A0A599 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCRBV5S2A0A599 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCRBV5S2A0A599 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCRBV5S2A0A599 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCRBV5S2A0A599 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCRBV5S2A0A599 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCRBV5S2A0A599 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCRBV5S2A0A599 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCRBV5S2A0A599 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCRBV5S2A0A599 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCRBV5S2A0A599 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCRBV5S2A0A599 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCRBV5S2A0A599 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCRBV5S2A0A599 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCRBV5S2A0A599 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCRBV5S2A0A599 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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