Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRV1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PRV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PRV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A1W2PRV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A1W2PRV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A1W2PRV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A0A1W2PRV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PRV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PRV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PRV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A1W2PRV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms