Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GV50

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GV50 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A1B0GV50 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1B0GV50 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1B0GV50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A1B0GV50 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1B0GV50 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1B0GV50 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1B0GV50 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1B0GV50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A1B0GV50 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A1B0GV50 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A1B0GV50 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A1B0GV50 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A1B0GV50 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A1B0GV50 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A1B0GV50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A1B0GV50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A1B0GV50 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A1B0GV50 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
A0A1B0GV50 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A0A1B0GV50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A0A1B0GV50 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms