Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUU8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUU8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A087WUU8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A087WUU8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A087WUU8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A087WUU8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A087WUU8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A087WUU8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WUU8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WUU8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUU8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUU8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 998.3 ms