Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KL1Q9Y6S9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KL1Q9Y6S9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KL1Q9Y6S9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS6KL1Q9Y6S9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KL1Q9Y6S9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms