Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5V3

MAGED1, Melanoma-associated antigen D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED1Q9Y5V3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAGED1Q9Y5V3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAGED1Q9Y5V3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAGED1Q9Y5V3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGED1Q9Y5V3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGED1Q9Y5V3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGED1Q9Y5V3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGED1Q9Y5V3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGED1Q9Y5V3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAGED1Q9Y5V3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGED1Q9Y5V3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGED1Q9Y5V3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGED1Q9Y5V3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAGED1Q9Y5V3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms