Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED3Q9Y3Q3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED3Q9Y3Q3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED3Q9Y3Q3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED3Q9Y3Q3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED3Q9Y3Q3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED3Q9Y3Q3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMED3Q9Y3Q3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMED3Q9Y3Q3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms