Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A2Q9UPR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC8A2Q9UPR5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC8A2Q9UPR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC8A2Q9UPR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC8A2Q9UPR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC8A2Q9UPR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A2Q9UPR5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms