Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP18Q9UMW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP18Q9UMW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP18Q9UMW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP18Q9UMW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP18Q9UMW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP18Q9UMW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP18Q9UMW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP18Q9UMW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP18Q9UMW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP18Q9UMW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms