Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BARX2Q9UMQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BARX2Q9UMQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
BARX2Q9UMQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BARX2Q9UMQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BARX2Q9UMQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BARX2Q9UMQ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BARX2Q9UMQ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BARX2Q9UMQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BARX2Q9UMQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms