Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MED23Q9ULK4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MED23Q9ULK4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
MED23Q9ULK4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
MED23Q9ULK4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MED23Q9ULK4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MED23Q9ULK4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MED23Q9ULK4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MED23Q9ULK4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MED23Q9ULK4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MED23Q9ULK4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MED23Q9ULK4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MED23Q9ULK4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms