Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCOLCE2Q9UKZ9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCOLCE2Q9UKZ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCOLCE2Q9UKZ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCOLCE2Q9UKZ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCOLCE2Q9UKZ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCOLCE2Q9UKZ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PCOLCE2Q9UKZ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms