Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMPXQ9UHP9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPXQ9UHP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMPXQ9UHP9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPXQ9UHP9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPXQ9UHP9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms