Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHORDC1Q9UHD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHORDC1Q9UHD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHORDC1Q9UHD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHORDC1Q9UHD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHORDC1Q9UHD1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHORDC1Q9UHD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHORDC1Q9UHD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms