Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNN3Q9UGI6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNN3Q9UGI6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNN3Q9UGI6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNN3Q9UGI6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNN3Q9UGI6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN3Q9UGI6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN3Q9UGI6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms