Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
USP35Q9P2H5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
USP35Q9P2H5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
USP35Q9P2H5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
USP35Q9P2H5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
USP35Q9P2H5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
USP35Q9P2H5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
USP35Q9P2H5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
USP35Q9P2H5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
USP35Q9P2H5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
USP35Q9P2H5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
USP35Q9P2H5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
USP35Q9P2H5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
USP35Q9P2H5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
USP35Q9P2H5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
USP35Q9P2H5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
USP35Q9P2H5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
USP35Q9P2H5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
USP35Q9P2H5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
USP35Q9P2H5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
USP35Q9P2H5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
USP35Q9P2H5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
USP35Q9P2H5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP35Q9P2H5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP35Q9P2H5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
USP35Q9P2H5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
USP35Q9P2H5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms