Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCHIP1Q9P0W5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCHIP1Q9P0W5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCHIP1Q9P0W5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCHIP1Q9P0W5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCHIP1Q9P0W5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCHIP1Q9P0W5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms