Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP4Q9P0V3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP4Q9P0V3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4Q9P0V3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4Q9P0V3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4Q9P0V3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP4Q9P0V3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP4Q9P0V3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4Q9P0V3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms