Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL6

SIDT1, SID1 transmembrane family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIDT1Q9NXL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIDT1Q9NXL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIDT1Q9NXL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIDT1Q9NXL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIDT1Q9NXL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIDT1Q9NXL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIDT1Q9NXL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIDT1Q9NXL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIDT1Q9NXL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIDT1Q9NXL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIDT1Q9NXL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIDT1Q9NXL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIDT1Q9NXL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms