Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLE3Q9NRF9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLE3Q9NRF9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLE3Q9NRF9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLE3Q9NRF9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLE3Q9NRF9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLE3Q9NRF9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLE3Q9NRF9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLE3Q9NRF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLE3Q9NRF9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLE3Q9NRF9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms