Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXOSC3Q9NQT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EXOSC3Q9NQT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC3Q9NQT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC3Q9NQT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC3Q9NQT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EXOSC3Q9NQT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EXOSC3Q9NQT5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC3Q9NQT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC3Q9NQT5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms