Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPHS2Q9NP85 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPHS2Q9NP85 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHS2Q9NP85 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHS2Q9NP85 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHS2Q9NP85 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHS2Q9NP85 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPHS2Q9NP85 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPHS2Q9NP85 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHS2Q9NP85 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NPHS2Q9NP85 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPHS2Q9NP85 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPHS2Q9NP85 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NPHS2Q9NP85 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms