Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK4Q9HAZ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK4Q9HAZ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK4Q9HAZ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK4Q9HAZ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLK4Q9HAZ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLK4Q9HAZ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms