Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN28AQ9H9Z2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIN28AQ9H9Z2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN28AQ9H9Z2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIN28AQ9H9Z2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIN28AQ9H9Z2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN28AQ9H9Z2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms