Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIPAS39Q9H9C1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIPAS39Q9H9C1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
VIPAS39Q9H9C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VIPAS39Q9H9C1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VIPAS39Q9H9C1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VIPAS39Q9H9C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
VIPAS39Q9H9C1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VIPAS39Q9H9C1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms