Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA6CQ9H3T2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA6CQ9H3T2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA6CQ9H3T2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA6CQ9H3T2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA6CQ9H3T2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA6CQ9H3T2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA6CQ9H3T2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.9 ms