Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GTPBP4Q9BZE4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GTPBP4Q9BZE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GTPBP4Q9BZE4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTPBP4Q9BZE4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTPBP4Q9BZE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTPBP4Q9BZE4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTPBP4Q9BZE4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GTPBP4Q9BZE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTPBP4Q9BZE4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTPBP4Q9BZE4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms