Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HERC2P3Q9BVR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HERC2P3Q9BVR0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HERC2P3Q9BVR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HERC2P3Q9BVR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HERC2P3Q9BVR0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HERC2P3Q9BVR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HERC2P3Q9BVR0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HERC2P3Q9BVR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERC2P3Q9BVR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms