Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PI4K2AQ9BTU6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PI4K2AQ9BTU6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PI4K2AQ9BTU6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PI4K2AQ9BTU6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PI4K2AQ9BTU6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PI4K2AQ9BTU6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PI4K2AQ9BTU6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PI4K2AQ9BTU6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PI4K2AQ9BTU6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PI4K2AQ9BTU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PI4K2AQ9BTU6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PI4K2AQ9BTU6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PI4K2AQ9BTU6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PI4K2AQ9BTU6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PI4K2AQ9BTU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms