Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GINS4Q9BRT9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINS4Q9BRT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GINS4Q9BRT9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GINS4Q9BRT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS4Q9BRT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GINS4Q9BRT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GINS4Q9BRT9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GINS4Q9BRT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms