Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTP3Q9BQQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTP3Q9BQQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RTP3Q9BQQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RTP3Q9BQQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RTP3Q9BQQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTP3Q9BQQ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTP3Q9BQQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RTP3Q9BQQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTP3Q9BQQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms