Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USB1Q9BQ65 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USB1Q9BQ65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USB1Q9BQ65 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USB1Q9BQ65 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USB1Q9BQ65 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USB1Q9BQ65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USB1Q9BQ65 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms