Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POP1Q99575 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POP1Q99575 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POP1Q99575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
POP1Q99575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
POP1Q99575 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POP1Q99575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POP1Q99575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
POP1Q99575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POP1Q99575 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
POP1Q99575 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
POP1Q99575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POP1Q99575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POP1Q99575 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
POP1Q99575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POP1Q99575 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POP1Q99575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POP1Q99575 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POP1Q99575 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POP1Q99575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POP1Q99575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POP1Q99575 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POP1Q99575 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POP1Q99575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
POP1Q99575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
POP1Q99575 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POP1Q99575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POP1Q99575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POP1Q99575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POP1Q99575 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POP1Q99575 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POP1Q99575 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POP1Q99575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
POP1Q99575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POP1Q99575 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POP1Q99575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POP1Q99575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POP1Q99575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POP1Q99575 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POP1Q99575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POP1Q99575 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POP1Q99575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POP1Q99575 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
POP1Q99575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POP1Q99575 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POP1Q99575 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POP1Q99575 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
POP1Q99575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POP1Q99575 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POP1Q99575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POP1Q99575 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POP1Q99575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POP1Q99575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POP1Q99575 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POP1Q99575 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POP1Q99575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POP1Q99575 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POP1Q99575 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POP1Q99575 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POP1Q99575 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POP1Q99575 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POP1Q99575 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POP1Q99575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POP1Q99575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POP1Q99575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POP1Q99575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POP1Q99575 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POP1Q99575 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POP1Q99575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POP1Q99575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POP1Q99575 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POP1Q99575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POP1Q99575 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POP1Q99575 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POP1Q99575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POP1Q99575 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POP1Q99575 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POP1Q99575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POP1Q99575 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POP1Q99575 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POP1Q99575 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
POP1Q99575 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POP1Q99575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
POP1Q99575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
POP1Q99575 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
POP1Q99575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
POP1Q99575 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
POP1Q99575 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POP1Q99575 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POP1Q99575 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
POP1Q99575 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POP1Q99575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POP1Q99575 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
POP1Q99575 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms