Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF778Q96MU6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF778Q96MU6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF778Q96MU6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF778Q96MU6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF778Q96MU6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF778Q96MU6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF778Q96MU6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF778Q96MU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF778Q96MU6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF778Q96MU6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF778Q96MU6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF778Q96MU6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF778Q96MU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF778Q96MU6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF778Q96MU6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF778Q96MU6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF778Q96MU6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms