Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
KCNH8Q96L42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
KCNH8Q96L42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.2■■■■■ 4.51
KCNH8Q96L42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
KCNH8Q96L42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
KCNH8Q96L42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
KCNH8Q96L42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
KCNH8Q96L42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
KCNH8Q96L42 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
KCNH8Q96L42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
KCNH8Q96L42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
KCNH8Q96L42 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
KCNH8Q96L42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
KCNH8Q96L42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
KCNH8Q96L42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
KCNH8Q96L42 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
KCNH8Q96L42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.72■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
KCNH8Q96L42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
KCNH8Q96L42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
KCNH8Q96L42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
KCNH8Q96L42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
KCNH8Q96L42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms