Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms