Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC120Q96HB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC120Q96HB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC120Q96HB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC120Q96HB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC120Q96HB5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC120Q96HB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC120Q96HB5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms