Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN7L3BQ96GX2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ATXN7L3BQ96GX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN7L3BQ96GX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN7L3BQ96GX2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7L3BQ96GX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN7L3BQ96GX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATXN7L3BQ96GX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATXN7L3BQ96GX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN7L3BQ96GX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN7L3BQ96GX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN7L3BQ96GX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms